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單細(xì)胞測(cè)序發(fā)現(xiàn)新的免疫前體細(xì)胞

2018-01-23
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CD4+輔助性T細(xì)胞通常在免疫反應(yīng)中扮演中間角色,協(xié)助產(chǎn)生其他類型的免疫細(xì)胞。不過(guò),據(jù)《Science Immunology》報(bào)道,在某些情況下,比如存在慢性病毒感染,一部分的CD4+輔助性T細(xì)胞會(huì)變成細(xì)胞毒性T細(xì)胞(CD4-CTL)。
La Jolla過(guò)敏與免疫研究所等機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)9,000多個(gè)CD4+ T細(xì)胞開(kāi)展單細(xì)胞RNA測(cè)序,這些細(xì)胞來(lái)自世界各地的捐獻(xiàn)者,包括斯里蘭卡和尼加拉瓜。他們發(fā)現(xiàn),CD4-CTL來(lái)源于一部分稱為CD4-TEMRA的T細(xì)胞。

研究人員從健康的成人捐獻(xiàn)者中采集血樣,并分離出外周血單個(gè)核細(xì)胞,這不僅包括T細(xì)胞,還包括B細(xì)胞、NK細(xì)胞和單核細(xì)胞。之后,他們進(jìn)行細(xì)胞分選,并分離出T細(xì)胞進(jìn)行RNA測(cè)序。

一些獻(xiàn)血者之前曾受登革熱病毒或人巨細(xì)胞病毒的感染,這兩種病毒都會(huì)影響CD4-CTL。對(duì)于三名曾經(jīng)感染登革熱病毒的獻(xiàn)血者,研究人員比較了CD45RA(TEMRA)、效應(yīng)記憶T細(xì)胞(TEM)和中央記憶T細(xì)胞(TCM)中CD4+ T細(xì)胞的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組。

研究人員發(fā)現(xiàn),登革熱感染者的TEMRA亞群中富含111個(gè)轉(zhuǎn)錄本。他們指出,許多轉(zhuǎn)錄本,如GZMB、SPON2和CX3CR1,與CD8+ T淋巴細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞的細(xì)胞毒性能力有關(guān),而另一些轉(zhuǎn)錄本編碼與CTL功能相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子,如ZNF683和TBX21。這確認(rèn)了TEMRA細(xì)胞富含CD4-CTL。

通過(guò)比較單細(xì)胞和大量細(xì)胞的T細(xì)胞抗原受體庫(kù),研究人員發(fā)現(xiàn)與TEM和TCM細(xì)胞相比,TEMRA細(xì)胞亞群表現(xiàn)出更大的克隆擴(kuò)增。此外,通過(guò)比較各個(gè)人群CD4-CTL的克隆性和轉(zhuǎn)錄組,他們也發(fā)現(xiàn)CD4-TEMRA細(xì)胞之間是高度異質(zhì)的。

之后,利用聚類軟件,研究人員發(fā)現(xiàn)CD4-TEMRA細(xì)胞可以分成四個(gè)亞組。通過(guò)分析和比較轉(zhuǎn)錄組,他們發(fā)現(xiàn)兩個(gè)亞組可能包含CD4-CTL效應(yīng)物,而另外兩個(gè)亞組似乎是它們的記憶前體細(xì)胞。1和2的特征是高水平的KLRG1和低水平的IL-7R,而3和4的特征是低水平的KLRG1和高水平的IL-7R。

研究人員認(rèn)為,更好地了解CD4-CTL前體將有助于改善疫苗的免疫應(yīng)答。人們可開(kāi)發(fā)一些策略,以促進(jìn)病毒感染和癌癥后的疫苗接種有持續(xù)的CD4-CTL免疫應(yīng)答。
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